Brela (plaže i park šuma)
Čambina (Repaš)
Dolina Blaca (o. Brač)
Dolina potoka Slapnica (PP Žumberak - Samoborsko gorje)
Dolina rijeke Kupe (? samo predloženi?)
Dolina rijeke Kupčine (Krašić)
Dolina rijeke Slunjčice
Dolina Zelenjak (klanac Sutle)
Donji Kamenjak i Medulinski arhipelag
Erdut
Gornji Kamenjak (Medulin)
Grab (potok kod Trilja, pritok Rude)
Gračišće-Pićan
Imotska jezera - Gaj (obuhvaća Modro i Crveno jezero)
Jelas polje (Brodsko-posavska županija)
Južna obala otoka Hvara
Kalnik
Kanjon Cetine
Karišnica i Bijela (Obrovac, Benkovac)
Klek
Konavoski dvori
Križnica (Pitomača)
Labin-Rabac-Prklog
Limski zaljev
Lopar
Odransko polje
Okolica Okić grada (Okić grad – Samobor)
Okolina Istarskih toplica (Oprtalj)
Pakleni otoci
Pašnjak Gajna (Oprisavci, Brodsko-posavska županija)
Pašnjak Iva (Brodsko-posavska županija)
Pazinski ponor
Područje Sutinskih Toplica (Hrvatsko zagorje)
Prološko Blato (Imotsko polje)
Ravnik (otok na jugoistočnoj obali Visa) - gnijezdilište kolonije galeba klaukavca (Larus cachinnans); makija i alepski bor
Rijeka Mura
Rijeka Slušnica (Slunjćica) kod Slunja
Rovinjski otoci i priobalno područje
Ruda (riječni kanjon i mlinica)
Rumin (potok, pritok Cetine kraj Hrvaca; ima staru mlinicu)
Sjevernozapadni dio Dugog otoka
Sovsko jezero (Slavonska Požega)
Spačva
Sutina (kanjon i gornji tok potoka); pod bjelogoričnom šumom
Šćedro (otok blizu južne obale o. Hvara)
Širinski otok (Pitomača)
Učka jug (Kršan, Plomin)
Učka sjever (Lupoglav)
Vidova gora (o. Brač)
Vodeni tok i kanjon Čikole (Drniš)
Zečevo (otok kraj sjeverne obale o. Hvara)
Zelenjak - Risvička i Cesarska gora (Krapinsko-zagorska županija)